Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM1B2RUZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms