Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF839A8K0R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF839A8K0R7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF839A8K0R7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms