Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2BA6NLU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM2BA6NLU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms