Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDR42E2A6NKP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms