Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HELTA6NFD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HELTA6NFD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms