Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L3A6NEY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L3A6NEY3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms