Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PSDA5PKW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PSDA5PKW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSDA5PKW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSDA5PKW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms