Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP5LA4QPB2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRP5LA4QPB2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRP5LA4QPB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms