Protein–RNA interactions for Protein: A4D174

C7orf71, Putative uncharacterized protein C7orf71, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf71A4D174 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C7orf71A4D174 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C7orf71A4D174 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C7orf71A4D174 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms