Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC26A0AVF1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC26A0AVF1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC26A0AVF1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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