Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X1B8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms