Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms