Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT52Q9Y366 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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