Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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