Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXD3Q9UJU5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms