Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms