Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TBCCD1Q9NVR7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms