Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms