Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms