Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms