Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms