Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms