Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms