Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms