Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2AFJQ9BTM1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms