Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms