Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms