Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX18Q96RF0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms