Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDC1Q96MU7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms