Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJA3Q96EY1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA3Q96EY1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms