Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms