Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF138Q8WVD3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms