Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N9G6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms