Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARP9Q8IXQ6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PARP9Q8IXQ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms