Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMS1Q86UR5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms