Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCQ7RTU9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms