Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP43Q70EL4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP43Q70EL4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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USP43Q70EL4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP43Q70EL4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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