Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms