Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRMS1LQ5PSV4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRMS1LQ5PSV4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms