Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms