Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA8Q53HL2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms