Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms