Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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