Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAMK4Q16566 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK4Q16566 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms