Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ATP6AP1Q15904 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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