Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC85BQ15834 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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