Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms