Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms