Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMS2P11Q13670 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms