Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms